Для активации полупрозрачности слоёв в Altium Designer используйте команду через меню в PCB редакторе:

Tools -> Preferences -> PCB Editor (слева в колонке) -> Display -> Jump to activate view configuration...  (внизу страницы)

Активируйте Altium Transparent 2D

Функция весьма удобна - видны артефакты под паттернами, которые иногда мешают.